【2026年版】滋賀県未来投資総合補助金とは

滋賀県未来投資総合補助金とは？

滋賀県未来投資総合補助金は、滋賀県内の

• 中小企業

• 小規模事業者

などが、

• 生産性向上

• 持続的な賃上げ

に取り組むための補助金です。

• 人手不足

• 長引く物価高騰

といった厳しい経営環境に直面している滋賀県内の

• 中小企業

• 小規模事業者

などを対象とした県の補助金制度です。

最大の特徴は、単なる資金援助ではなく、企業の持続的な賃上げを前提とした投資を応援するという点にあります。

国の物価高騰対応重点支援地方創生臨時交付金を活用して実施されており、2026年現在は要件を大幅にアップデートした第3弾が動いています。

制度概要（2026年第3弾最新スペック）

2026年に実施されている第3弾では、企業の規模（常時雇用する従業員数）に応じて、以下のように補助上限額や補助率が3つの区分に変動する仕組みです。

注意点

従業員数は、交付申請時点における常時使用する従業員であり、県内事業所に賃上げ前・後の両期間とも在籍する全従業員の人数でカウントされます。 

出典：滋賀県未来投資総合補助金（第3弾）手引き

参考：滋賀県未来投資総合補助金（第3弾） 

2026年の二次募集は8月21日まで

2026年の二次募集は、2026年6月8日（月）から8月21日（金）17:00まで実施されています。

ただし、交付予定額が予算額に達すると見込まれる場合は、募集期間中でも申請受付が終了する場合があります。

また、滋賀県未来投資総合補助金（第2弾）の支給事業者は、二次募集から第3弾への申請が可能です。

一次募集で不採択となった事業者も、不採択の理由を解消したうえで二次募集に申請できます。

目的と対象事業

本補助金は、滋賀県内の中小企業が厳しい経営環境を乗り越え、持続的な成長を遂げることを目的としています。

コアにある目的は、持続的な賃上げとその原資となる付加価値額の増加（企業の成長）をセットで実現することです。

そのため、申請にあたっては以下の賃上げ要件が必須です。

必須の賃上げ要件

常時使用する従業員の平均賃金を、令和7年12月支給賃金と比べて、令和8年1月1日から補助事業完了までに3.5％以上増加させることが要件です。

平均賃金は、計算対象となる従業員のひと月当たりの基本給等の合計をひと月当たりの労働時間で割って算定します。

計算対象となるのは、以下の条件をすべて満たす従業員です。

• 滋賀県内の事業所に在籍している

• 正規雇用、契約社員、パート・アルバイトに該当する

• 令和7年12月（賃上げ前）と令和8年の任意の月（賃上げ後）の両期間に在籍している

派遣社員

• 青色申告専従者

• 役員（従業員と兼務している場合を除く）

• 賃上げ前後のいずれか一方しか在籍していない従業員

• は、原則として計算対象から除外します。

賃上げ後の比較月は、令和8年1月以降の任意の月を使用できます。

賃上げを実施したことは、実績報告時に確認されます。

参考：「滋賀県未来投資総合補助金（第3弾）」3月2日(月)から募集開始します！

2026年の最新動向とスケジュール

2026年の動向として最も注目すべきは、過去の

• 第1弾

• 第2弾

から補助要件や枠組みが大きく変更された点です。以前は

• 通常枠

• 賃上げ枠

に分かれていましたが、第3弾では全員が3.5%以上の賃上げ必須となり、規模（人数）に応じた上限額設定に一本化されました。

2026年のスケジュール

1. 一次募集→2026年3月2日（月）〜3月31日（火）※終了

2. 二次募集→2026年6月8日（月）〜8月21日（金）17:00

3. 補助対象期間→交付決定日〜2026年12月31日（木）

今から申請を考える際の重要ポイント

二次募集は8月21日17:00まで

二次募集は2026年6月8日（月）から8月21日（金）17:00まで実施されています。

ただし、交付予定額が予算額に達すると見込まれる場合は、募集期間中でも受付が終了する場合があります。

第2弾の支給事業者は二次募集から申請可能

滋賀県未来投資総合補助金（第2弾）の支給事業者は、第3弾の一次募集には申請できませんでしたが、二次募集から申請可能です。

なお、第1弾・第2弾で申請した費用を、追加購入なしで重複して申請することは認められません。

申請前に最新情報を確認

二次募集の受付期間や予算の消化状況は変更される可能性があります。

申請前に、滋賀県未来投資総合補助金（第3弾）の公式サイトで最新情報を確認してください。

出典：滋賀県未来投資総合補助金とは

◆予算上限による早期終了に注意

募集期間内であっても、申請額が予定額に達すると見込まれた時点で受付が早期終了することが明記されています。

一次募集でも中盤で申請額が50%を超過したとのアナウンスが出るなど人気が高いため、二次募集を狙う場合は6月の開始直後に電子申請システムから提出できるよう、今から書類や3.5%の賃上げ計画の準備を進めておくことを強くおすすめします。

みんなの補助金コンシェルジュでは、滋賀県未来投資総合補助金の申請サポートを無料で実施しています。

採択率を高めたい方はお気軽にご相談ください。

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滋賀県未来投資総合補助金の対象者

本補助金の対象となるのは、以下の基本条件をすべて満たす事業者です。

• 常時使用する従業員を1名以上雇用していること。

• 必須の賃上げ要件（2025年12月比で平均賃金を3.5%以上増加）を達成する計画があること。

• 滋賀県内に事務所または事業所を有し、県内で補助事業を実施する中小企業・小規模事業者等（個人事業主を含む）であること。

従業員の人数（規模）によって、以下のように3つの区分（A〜C）に分かれ、

• 補助率

• 補助上限額

が変動します。

中小企業・小規模事業者の区分

従業員数のカウントに注意

交付申請時点における常時使用する従業員であり、滋賀県内の事業所に

• 賃上げ前（2025年12月）

• 賃上げ後（補助事業完了まで）

の両方の期間、継続して在籍している人数で判定されます。

そのため、従業員ゼロ（事業主本人のみ）の事業者は対象外です。

業種条件

滋賀県未来投資総合補助金は、基本的に幅広い業種が対象です。

一般的な補助金では対象外になりがちな第一次産業（農業・漁業など）も広くカバーされているのが特徴です。

◆対象となる主な業種

本補助金は、

• 製造業

• サービス業

といった一般的な業種だけでなく、以下のように非常に幅広い業種が対象として認められています。

• 漁業

• 製造業

• 建設業

• 卸売業

• 小売業

• 飲食業

• サービス業

• 不動産業

• 農業・林業

• 医療・福祉

• 情報通信業

• 宿泊・旅館業

• 運輸業・物流業

• その他

※複数の事業を営んでいる場合は、最も事業規模（売上など）が大きい業種を選択して申請します。

対象外となるケース（不採択・申請不可の要件）

中小企業の規模であっても、以下のケースに該当する場合は対象外（申請不可、または審査で除外）です。

①みなし大企業に該当する場合

大企業の実質的な支配下にあると見なされる中小企業は対象外です。

• 同一の大企業に発行済株式の2分の1以上を所有されている

• 複数の大企業に発行済株式の3分の2以上を所有されている

• 大企業の役員または職員を兼ねている者が、役員総数の2分の1以上を占めている

②過大な所得、巨額の所得がある場合

確定（申告済み）している直近過去3年分の各年、または各事業年度の課税所得の平均年額が15億円を超える中小事業者。

③税金の未納や法令違反・公序良俗に反する業種

• 県税に未納（滞納）がある者

• 暴力団、または暴力団員と関わりのある者

• 性風俗関連特殊営業、およびそれに類似する業種を営む者

• 特定の宗教・政治団体と関わる場合や、業務内容が公序良俗に反する営業を行っている事業者

④その他の組織・施設

• 事業を営んでいない、法人格のある自治会など

• 国、県、市町（共済組合含む）の施設を管理・運営する者（※ただし、その施設以外で行う独立した事業であれば対象となる場合がある）

参考：中小企業の定義に関するよくある質問 

2026年第2弾の補助金支給事業者について

滋賀県未来投資総合補助金（第2弾）の補助金支給事業者は、第3弾の一次募集には申請できませんでしたが、二次募集から申請可能です。

ただし、第1弾または第2弾で申請した費用を、追加購入なしで重複して申請することは認められません。

【あわせて読みたい！】設備投資に使える補助金は？【中小企業・個人事業主向け】 

みんなの補助金コンシェルジュでは、設備投資・DX導入に強い専門家が事業計画作成から申請までサポートしています。

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補助対象経費一覧（基本の経費区分）

補助金の対象となる経費は、大きく以下の6つの区分に分かれています。

これらを単体、あるいは組み合わせて申請することが可能です。

対象になりやすい経費と具体例

特に申請が多く、採択されやすいコアな経費について、具体的な活用例を交えて解説します。

設備導入費・機械装置費

• 生産ラインの自動化

• 老朽化した設備の高効率化

など、生産性向上（省人化・業務効率化）に直結するハードウェアの購入が対象になりやすいです。

◆具体的な経費例

• サロンやクリニックにおける最新の施術・検査機器

• 農業におけるスマート農業機器（ドローンや自動操舵システムなど）

• 製造業における自動化ロボット、NC工作機械、高精度加工機の導入

• 商業・サービス業における自動券売機、自動精算機、省エネ型業務用冷蔵庫への更新

設備投資で対象外になりやすいケース

単なる

• 事務用のパソコン

• 一般的なスマートフォン・タブレット

は、汎用性が高すぎる（他目的にも使える）ため、原則として対象外となるケースがほとんどです。ただし、

• 専用ソフトウェア

• 特定の制御用システム

を稼働させるために不可欠な端末である場合は、セットで認められることがあります。

システム導入費・DX関連費用

2026年現在、多くの企業が直面している人手不足を解消するための

• クラウドサービスの導入費用

• デジタル化（DX）に関するソフトウェア

は、非常に高く評価されやすい傾向にあります。

◆具体的な経費例

• セキュリティ強化→クラウド環境への移行に伴う各種セキュリティソフトの導入費用

• 業務プロセスの改善→ERP（基幹業務システム）、生産管理システム、在庫管理・発注システムの構築

• 顧客対応のデジタル化→顧客管理システム（CRM）、商談管理ツール（SFA）、AIチャットボットの導入

• バックオフィス効率化→クラウド型の勤怠管理システム、給与計算・財務会計ソフト、電子契約システムの導入

◆外注費（役務費）

自社にノウハウがない専門的な作業を、外部のITベンダーやコンサルタント、制作会社に委託する費用です。

出典：外注工賃とは？外注費との違い

◆具体的な経費例

• 専門的な機械を設置・稼働させるためのセットアップ・初期設定費用

• 新商品のデザインや、ブランディングを外部のデザイナーに委託する費用

• 新システムを自社仕様にカスタマイズしてもらうための開発・設定委託費

• 新事業展開、新サービス開始に伴う自社ECサイトの構築やWebサイトのリニューアルの制作外注費

経費に関する重要な注意点

• 交付決定前の購入はNG→補助金の交付決定通知が届く前に契約・発注・支払いをしてしまった経費は、原則として補助対象にならない。必ず採択され、交付決定を受けてから動くスケジュールを組む。

• 賃上げとの連動性→導入する設備やシステムによって、どのように業務が効率化され、その結果平均賃金3.5%以上アップの原資（利益）を生み出せるのか、というストーリーが事業計画書でロジカルに説明されている必要がある。

• 見積書を準備する→申請時には、経費の積算根拠となる見積書などの書類が必要。1件当たり50万円（税抜）以上の物品・サービスを発注する場合は、原則として2者以上から相見積もりを取得し、適正な価格を選択する。1者のみの見積もりとする場合は、選定理由書が必要。

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対象外になりやすい経費

• 人件費

• 消耗品

• 汎用PC

滋賀県未来投資総合補助金（2026年・第3弾）において、対象外になりやすい経費（人件費、汎用PC、消耗品など）について詳しく解説します。

補助金を申請する際、事業に必要だからといって何でも経費に含めてしまうと、

• 不採択になる

• その項目だけ審査で丸ごと削られる

などの原因です。

特に以下の3つの経費は原則として対象外、あるいは非常に厳しい制限があるため注意が必要です。

人件費（原則として一律対象外）

多くの事業者が、設備を入れて業務を効率化させる間、従業員を動かすための人件費（給与）も補助してほしいと考えがちですが、社内スタッフの人件費は一律で対象外です。

◆対象外となる具体的なケース

• 自社の経営者や役員、従業員（パート・アルバイト含む）に支払う給与、手当、賞与

• 補助事業（新しい設備の導入作業や新商品の開発など）に直接従事した時間分の社内人件費

◆なぜ対象外なのか？

この補助金は、企業の未来への投資（設備やシステム）を支援し、その結果として企業が自力で持続的な賃上げ（人への投資）を行うことを目的としています。

そのため、行政が直接人件費を肩代わりすることはありません。

◆例外（認められる人への経費）

自社スタッフではなく、外部の

• ITコーディネーター

• 中小企業診断士

などの専門家にアドバイスを求める際の専門家経費（謝金・旅費）や、外部業者に作業を丸ごと委託する外注費（役務費）であれば対象です。

【あわせて読みたい！】みらいエコ住宅2026事業の補助金・支援情報まとめ 

汎用PC・タブレット・スマートフォン（原則対象外）

• パソコン

• タブレット

• スマートフォン

• 周辺機器（プリンターやモニターなど）

は、汎用性（日常の事務や私生活など、補助事業以外の目的でも使える性質）が高すぎるという理由で、原則として補助対象になりません。

◆対象外となる具体的なケース

• 連絡用として契約・購入するスマートフォン

• 事務作業やメール送受信用に購入する一般的なノートパソコン

• 店舗のメニュー表示や、一般的な営業活動に使うためのタブレット（iPadなど）

◆例外として認められるケース（非常に限定的）

その端末がないと、導入する専用システムや機械が100%稼働しないと客観的に証明できる場合は、セットで認められることがあります。

例）

• 新しく導入するPOSレジシステムの専用端末として、完全にレジ機能のみに固定して使用するタブレット

• 生産ラインを制御・監視するためだけに工場内に固定設置し、他の用途（ネット検索や事務など）には一切使わない専用制御用PC

消耗品・事務用品費（原則対象外）

日々の業務で使用する消耗品や事務用品は、原則として補助対象外です。

◆対象外となる具体的なケース

• 作業用の手袋、マスク、一般的な工具類、清掃用品

• コピー用紙、文房具、インクカートリッジなどの事務用品

• 単価が極めて低い、または法定耐用年数が短い（1年未満など）少額の備品

◆例外として認められるケース

経費区分の中に⑤原材料・副資材費という項目があります。

新商品や新サービスの開発・試作、あるいは実験に直接使用され、そのためだけに消費されたことが明確に証明できる原材料であれば、例外的に認められます。

ただし、そのまま一般販売する商品の仕入れ（在庫）にあたるものは対象外です。

まとめ～経費漏れを防ぐためのチェックポイント

滋賀県未来投資総合補助金に限らず、公的な補助金では

• 目的外の用途に転用できないもの

• 補助事業の期間内（～2026年12月31日）に発注・納品・支払いがすべて完了するもの

だけが厳格に対象です。

「これは対象になるかな？」と迷う経費がある場合は、事業計画書に含める前に、最新の公募要領や補助対象経費の資料を確認しましょう。

補助事業は交付決定日以後に開始し、2026年12月31日までに完了する必要があります。

交付決定前の発注・契約は補助対象外となるため注意が必要です。

申請スケジュールと流れ

本補助金は、事前の準備から事業完了後の報告まで、計画的に手続きを進める必要があります。

2026年の最新スケジュールに沿った全体像は以下の通りです。

2026年の全体スケジュール

1. 一次募集→2026年3月2日（月）〜3月31日（火） ※終了

2. 二次募集→2026年6月8日（月）〜7月17日（金）

3. 補助対象期間： 交付決定日 〜 2026年12月31日（木）

申請の流れ～6つのステップ

①公募要領を確認する

まずは滋賀県の公式特設サイトから最新の公募要領をダウンロードし、自社の従業員数（1〜5名／6〜20名／21名以上）に応じた補助上限や、対象経費のルールを細かく確認します。

②申請システムを確認する

本補助金の申請は、国の電子申請システムで行われます。

本補助金の交付申請は、滋賀県未来投資総合補助金事務局が用意するシステムから電子申請します。

申請に必要な書類を準備したうえで、公式の申請ページから手続きを行ってください。

③事業計画を作成する

• 人材育成

• 生産性向上

• 新事業展開

のいずれか（または複数）に該当する投資計画を練り、平均賃金3.5%以上アップをどのように達成するかを具体的な数値に落とし込んだ事業計画書を作成します。

あわせてベンダーからの見積書も手配します。

④電子申請システムから書類を提出する

二次募集の期間は、2026年6月8日（月）から8月21日（金）17:00までです。申請に必要な

• 誓約書

• 見積書

• 役員名簿

• 事業計画書

• 補助対象経費積算明細書

などを準備し、事務局が用意するシステムから申請します。

なお、交付予定額が予算額に達すると見込まれる場合は、募集期間中でも受付が終了する場合があります。

⑤審査・採択後に交付決定を受けてから着工する

提出された計画書が審査され、採択されると交付決定通知書が届きます。

必ずこの通知を受け取ってから、設備の

• 契約

• 発注

• システム導入

の支払いを行ってください。

⑥事業完了後に実績報告を行う

補助対象期間は、交付決定日から2026年12月31日（木）までです。

補助事業は2026年12月31日までに完了させる必要があります。

実績報告書は、補助事業完了後30日以内、または2027年1月31日のいずれか早い日までに提出しましょう。実績報告では、

• 領収書

• 納品書

• 成果物

など、

• 補助対象経費の支出

• 事業の実施を確認できる書類

を提出します。

参考：「滋賀県未来投資総合補助金」の補助対象事業者（執行団体）

事業計画を作成する際のポイント

本補助金は、

• 人材育成

• 生産性向

• 新事業展開

に資する取組を通じて、賃上げの原資となる付加価値額を増加させることを目的としています。

事業計画を作成する際は、補助対象となる取組と賃上げとのつながりがわかるよう、以下の内容を具体的に整理しましょう。

生産性向上の効果を具体化する

設備やシステムの導入によって、

• 人員

• 作業時間

• 処理能力

などがどのように変化するのかを具体的に示します。

新事業展開の内容を明確にする

• 新商品

• 事業転換

• 業態転換

• 新サービスの開発

• 新事業の立ち上げ

などについて、

• 経費

• 導入する設備

との関係を明確にします。

賃上げにつながる計画を示す

平均賃金3.5％以上の増加要件を満たすため、補助事業によってどのように付加価値を増加させ、賃上げにつなげるのかを具体的に整理しましょう。

事業計画で確認したいポイント

数値計画を具体化する

頑張って賃上げするといった抽象的な説明ではなく、

• 設備

• システム

の導入によって、

• 売上

• 生産量

• 作業時間

などにどのような変化が見込まれるのかを具体的に整理しましょう。

投資目的を明確にする

導入する設備やシステムが、自社のどの課題を解決し、

• 人材育成

• 生産性向上

• 新事業展開

のいずれにどのようにつながるのかを明確にします。

事業内容と経費の整合性を確認する

申請する経費が事業計画の内容と一致しているか、補助対象経費として認められるものかを、

• 公募要領

• 補助対象経費

の資料で確認しましょう。

出典：ターゲットマーケティング(ターゲティング)とは？

滋賀県未来投資総合補助金でよくある質問（Q&A）

Q1. 個人事業主も対象ですか？

法人だけでなく、個人事業主の方も広く対象です。

ただし、本補助金（第3弾）は持続的な賃上げを前提とした投資を支援する制度であるため、交付申請時点で常時使用する従業員を1名以上雇用していることが必須条件です。

そのため、事業主本人のみ（従業員ゼロ）のいわゆる

• 一人親方

• 完全な副業

の形態の方は対象外です。

Q2. 他の補助金と併用できますか？

同じ

• 設備

• システム

に対して、国や他の自治体の補助金を二重に受け取ることはできません（重複申請の禁止）。

ただし、たとえば生産ラインの機械は国のものづくり補助金を使い、バックオフィスのクラウドシステム導入や従業員のリスキリングにはこの滋賀県未来投資総合補助金を使うといったように、別の取り組み（異なる経費）であれば、時期を合わせて上手に併用・活用することは可能です。

Q3. パソコン購入だけでも申請できますか？

一般的な

• タブレット

• スマートフォン

• 事務用パソコン

の購入だけでは申請できません。

これらは汎用性が高く、他の業務や私生活でも使えるものとみなされ、原則として対象外経費に指定されているためです。

ただし、システムとセットで認められる例外もあります。

したがって、システム導入などを伴わないパソコンの購入だけの申請は一律で対象外です。 

Q4. 採択後に変更は可能ですか？

やむを得ない事情がある場合に限り、事前に事務局へ変更承認申請を行って承認されれば変更可能です。

たとえば、半導体不足などで当初予定していた機械の型番が変わり、同等品に変更する場合などが該当します。ただし、

• 勝手に別の機械を買い直す

• 補助金を申請した時よりも大幅に安いものに変える

ということは認められません。

また、いかなる理由があっても、必須要件である3.5%以上の賃上げ計画そのものを後から下方修正することはできませんので、ご注意ください。

Q5. 滋賀県未来投資総合補助金の申請期間（スケジュール）はいつからいつまでですか？

A5. 2026年の二次募集は、2026年6月8日（月）から8月21日（金）17:00までです。ただし、交付予定額が予算額に達すると見込まれる場合は、募集期間中でも受付が終了する場合があります。

Q6. 採択結果の通知はいつ頃届きますか？

A6. 公募締め切り後、事務局による審査を経て、通常は約1ヶ月〜1.5ヶ月程度で採択結果および交付決定の通知が届きます。

正確な時期は、滋賀県の公式特設サイトにて随時アナウンスされます。

Q7. この補助金の採択率はどのくらいですか？

A7. 本補助金の採択率を示す公表データは、現時点では確認できません。

採択率を一律に評価することはできないため、最新の採択結果や公式発表を確認しましょう。

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